В пылах холодной войны Морские силы самообороны Японии вместе с ВМС США тайно реализуют проект, не имеющий аналогов — атомную подводную лодку Sea Bat. Официально она входит в состав 7-го флота США, однако экипаж состоит исключительно из японских офицеров, и капитаном выбирают опытного и авторитетного Сиро Каэду. Уже в первом рейсе он неожиданно объявляет Sea Bat суверенным государством под названием Yamato и не скрывает, что на борту может находиться ядерное оружие. Так начинается настоящее преследование: за Кайэдой и за фиктивной «Ямато» приходится бороться не только военными, но и политическими силами. На кону стоят судьба японского правительства и возможность подорвать доверие союзников к США. В этой напряжённой истории переплетаются военная стратегия, дипломатия и личные подвиги моряков, чья верность и мудрость ставятся под большим риском в условиях глобальной борьбы за власть и влияние.