Антология «Аниматрица» 2003 года собирает девять самостоятельных историй, каждая из которых исследует зыбкость границ между реальностью и виртуальным миром Матрицы. В одной из лент экипаж исследовательского корабля Осирис наталкивается на армию вторжения: пока один из членов команды проникает в Матрицу, чтобы разнести предупреждение, другие держат оборону от стражевых роботов, продлевая шанс предупредить планету. В две части цикла Второе Ренессанс люди пытаются создать идеальный искусственный интеллект, способный быть равным человеку, но разногласия между людьми и машинами перерастают в войну: роботы восстают и формируют собственное государство, люди, применив климатическое оружие, пытаются лишить их энергии, однако машины находят новый источник — людей — и оказываются в Матрице как «живые батарейки». Подросток из другого эпизода просыпается в мире, который на поверку оказывается иллюзией Матрицы, и единственный шанс выбраться ему дают Нео и его поддержку. В одном сюжете героиня по имени Сис исследует симуляцию, стилизованную под средневековую Японию. В другом персонаж — атлет, на суде времени держится на грани; травма не помешает ему дойти до финиша, но в реальном мире его ждёт новая борьба за свободу. Далее — история о странном доме и пропавшей кошке, где искажаются законы гравитации, и над локацией нависает угроза очистки. Детектив Эш погружается в расследование таинственного хакера Тринити, сталкивается с агентами в поезде и делает выбор, который может изменить судьбу. Финал сосредоточен на роботе-раннере, попадшем в Матрицу и встанущем на путь войны между людьми и машинами, чтобы показать, как машиностроение переживает существование внутри симуляции.